La revista nace con el nombre de Prociencia en 1977, con el apoyo financiero de Colciencias y del Cimpec, como órgano de comunicación de la Asociación Colombiana para el Avance de la Ciencia - ACAC Contaba con Consejo Editorial conformado en ese entonces por Josué Muñoz, del Cimpec, Alberto Ospina y Ovidio Oundjian de la ACAC, un editor invitado, especialista por cada número de la revista, un editor general que entonces era Rubén Ardila, y un director: José Peñaloza.
Prociencia, desarrollaba las siguientes secciones: Actividades científicas, Boletín de oportunidades, sugerencias de los lectores y acontecimientos nacionales e internacionales.
Prociencia puede considerarse como la primera publicación periódica de divulgación científica colombiana pero como sucede con muchas de las revistas a nivel nacional, es difícil publicarla con regularidad por falta de recursos económicos y porque los investigadores a quienes se les solicitaban artículos no tenían en ese entonces la mentalidad de divulgar sus proyectos.
Durante ocho años se suspendió la publicación, hasta cuando en 1991 hace su última aparición, en diferente formato, con las memorias de la Expociencia de 1989.
Innovación y Ciencia, se presenta por primera vez en la Convención Científica Nacional a comienzos de octubre de 1992, como el órgano de divulgación de la Asociación. "La nueva publicación esta orientada a difundir y divulgar todo lo pertinente a los campos científico e investigativo. Sus artículos son el producto de los puntos de vista de especialistas, pero escritos en un lenguaje sencillo para que sea entendido por el público en general."
Innovación y Ciencia nace con una nueva imagen en diseño, calidad de impresión, presentación y contenido. Se publica trimestralmente a partir de finales de 1992 y edita un número especial al final de todos los años.
Inicialmente se financió gracias al apoyo de Colciencias. Han hecho parte del Consejo Editorial personalidades a nivel nacional e internacional como José Fernando Escobar, León Lederman, Isabel Llano, Rodolfo Llinás, Abdus Salam, Nohora Elizabeth Hoyos, Alberto Ospina, Eduardo Posada, Manuel Elkin Patarroyo, Manuel Cardozo, Martha Patricia García, Carlos Corredor, Rodrigo Escobar Navia, Rodrigo Gutierrez, Guillermo Hoyos, Luis Eduardo Mora Osejo, Antonio Ordóñez Plaja, Efraím Otero, Jorge Rodríguez Arbeláez, Jorge Eliecer Ruiz, entre otros.
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